Objašnjeno: Kako radi test na koronavirus (COVID-19).

Kako PCR test traži virus u uzorcima brisa? Koliko ima do tamo? Koliko uzoraka Indija testira dnevno i može li testirati više? Ako može, zašto se još nije povećao?

Indija trenutno provodi dvofazni PCR u stvarnom vremenu za testiranje na SARS-COV-2. (Reuters)

Koji je dijagnostički test za novi koronavirus koji uzrokuje COVID-19?

The Indijsko vijeće za medicinska istraživanja (ICMR) objavilo je imenovane laboratorije koristit će konvencionalni test lančane reakcije polimeraze (PCR) u stvarnom vremenu, koji se provodi na brisu prikupljenom sa stražnje strane grla, tekućem uzorku iz donjeg respiratornog trakta ili jednostavnom uzorku sline. Takvi se testovi obično koriste u otkrivanju virusa gripe A, gripe B i H1N1.

Što je PCR test?

Koristi tehniku ​​koja stvara kopije segmenta DNK. 'Polimeraza' se odnosi na enzime koji prave kopije DNK. 'Lančana reakcija' je način na koji se fragmenti DNK kopiraju, eksponencijalno - jedan se kopira u dva, dva se kopiraju u četiri, i tako dalje. Kary Mullis, američki biokemičar koji je izumio PCR tehniku, dobio je Nobelovu nagradu za kemiju 1993. godine.

Međutim, SARS-COV-2 je virus napravljen od RNA, koji se mora pretvoriti u DNK. Za to tehnika uključuje proces koji se naziva reverzna transkripcija. Enzim 'reverzna transkriptaza' pretvara RNK u DNK. Zatim se izrađuju i umnožavaju kopije DNK. Fluorescentna boja koja veže DNA nazvana sonda pokazuje prisutnost virusa. Test također razlikuje SARS-COV-2 od drugih virusa.

Koliko dugo traje PCR proces?

PCR u stvarnom vremenu smanjio je vrijeme potrebno za testiranje uzoraka na 4,5 sata s otprilike 6 sati ranije, rekao je znanstvenik ICMR dr. R R Gangakhedkar. Međutim, ukupno vrijeme obrade — od trenutka kada su uzorci prikupljeni do dostavljanja izvješća — je oko 24 sata i trebalo bi biti manje, rekao je.

Objašnjeno: Pet koraka za otkrivanje koronavirusa

Kako se radi test u Indiji?

Indija trenutno provodi dvofazni PCR u stvarnom vremenu za testiranje na SARS-COV-2, rekao je NIMHANS-ov viši profesor i voditelj neurovirologije, dr. V Ravi. Prva faza osmišljena je za otkrivanje genetskih elemenata zajedničkih ljudskim koronavirusima koji mogu postojati u uzorku. Druga faza je dizajnirana za testiranje specifičnih gena prisutnih samo u virusu SARS-COV-2.

Do početka ožujka, početni pregled Test za provjeru bilo koje vrste koronavirusa obavili su svi laboratoriji, ali potvrdni PCR je napravio samo Nacionalni institut za virusologiju u Puneu. Zatim je NIV Pune prenio tehnologiju (reagense potrebne za potvrdu) u sve laboratorije kako ne bi bilo potrebe da uzorak ide sve do Punea. To je skratilo vrijeme potrebno za testiranje uzoraka, rekao je dr. Ravi.

Testiranje na koronavirus: lažna krv se vidi u epruvetama s oznakom koronavirusa (COVID-19) na ovoj ilustraciji snimljenoj 17. ožujka 2020. (Reuters ilustracija: Dado RuvicO

Testira li Indija dovoljno brojeva?

Indija ima kapacitet za testiranje 10.000 uzoraka dnevno, a trenutno testira oko 600-700. Za usporedbu, Južna Koreja, koja ima slično vrijeme obrade, navodno testira do 20.000 uzoraka dnevno, posebno koristeći modele poput svojih pogona za testiranje.

Vlada tvrdi da u ovoj fazi nije potrebno testirati svaku osobu. Zemlja testira skupinu koju za sada treba testirati, rekao je dr. Gangakhedkar. Ako idete na lokalizirani prijenos, testiramo dovoljno. Ako vjerujete da postoji prijenos u zajednici, onda je to drugo pitanje. Još uvijek nema dokaza za koje ne znamo kako je indeks oboljelih dobio ovu infekciju, rekao je.

Express Explained je sada na Telegramu. Klik ovdje da se pridružite našem kanalu (@ieexplained) i budite u toku s najnovijim

Ne želimo raditi nikakvo neselektivno testiranje jer sada svi traže test. Dakle, negdje ćemo to morati racionalizirati... ali također je važno paziti kako ne bismo propustili prijenos u zajednici, rekla je znanstvenica ICMR-a dr. Nivedita Gupta tijekom prošlog tjedna na brifingu za novinare.

Koja će biti strategija ako se dogodi prijenos u zajednici?

ICMR provodi nadzor za sve dokaze prijenosa u zajednici, pri čemu svaki od 52 indijska laboratorija za testiranje testira 20 nasumičnih uzoraka pacijenata s teškom akutnom respiratornom infekcijom (SARI). Očekuje se da će 'prvi rez' ovih testova biti objavljen u srijedu. ICMR je rekao da će vladine strategije biti potpuno drugačije, u slučaju da se otkrije slučaj prijenosa u zajednici iz ovih nadzornih testova.

Pandemija koronavirusa: U bolnici u New Delhiju. (PTI fotografija/datoteka)

Postoje li prepreke za povećanje testiranja?

Trošak je potencijalna prepreka, smatraju neki stručnjaci. Dužnosnici ICMR-a rekli su na konferenciji da je cijena primarnog testa na COVID-19 1500 Rs. Ako se treba napraviti drugi test kako bi se potvrdili rezultati prvog testa, ukupni trošak je oko 5000 Rs. Jedan od dužnosnika je također rekao da su korištene sonde, koje su uvezene iz Njemačke, ograničavajući faktor.

Dok je povećan broj centara za testiranje, porastao je i uvoz sondi. Prošlog tjedna Indija je htjela uvesti oko 200.000 sondi, dok je u ponedjeljak dr. Gangakhedkar rekao da vlada planira uvesti oko milijun.

Pandemija koronavirusa: Kada i koga testirati

Može li Indija raditi stvari drugačije?

Ono što je Indija počela raditi je upravo ono što je preporučeno za zemlju u koju je bolest uvezena, rekao je izvršni direktor Translational Health Science and Technology Instituta Indije, dr. Gagandeep Kang. Međutim, testiranje i praćenje onih koji dolaze u zemlju, te stavljanje pod nadzor onih s kojima su bili u kontaktu, racionalan je i prikladan pristup ako je jedini rizik bio uvoz bolesti, a praćenje i testiranje bilo 100 %, rekla je.

Ali ono što se može dogoditi je da s ovom infekcijom možete izgubiti i prije nego što razvijete simptome, a u vrlo rijetkih slučajeva možda nikada nećete imati simptome, pa biste je mogli prenijeti na druge ljude, a da ne znate da ste zaraženi, rekla je. Ova vrsta složenosti... čini nužnim razmisliti o rezervnoj strategiji kako biste vidjeli jeste li zaista nešto propustili, rekla je. Ima još toga što bismo mogli učiniti.

Hoće li ICMR nadzor pomoći?

Odluka ICMR-a dobar je korak, ali postoje regije koje bi takva vježba tada izostavila, rekao je dr. Kang. Ako svaki tjedan testirate uzorke iz svakog laboratorija za gripu, onda ako nađete i jedan pozitivan, to će vam reći da ste puno toga propustili, rekla je.

Prema dr. Kangu, moguće je upotrijebiti matematičko modeliranje kako bi se razumjelo što bi vladi dalo razumnu šansu da utvrdi postoji li već prijenos u zajednici. Mislim da bi bilo sjajno imati model kakav ima Singapur, gdje je svakom liječniku bilo gdje koji je imao kliničku sumnju, čak i ako ne odgovara opisu, bilo dopušteno poslati svog pacijenta na testiranje, dodala je.

– Prilozi šerifa Kaunaina M

Podijelite Sa Svojim Prijateljima: