Objašnjeno: Što je nova AY.12 pod-loza Delta varijante, i trebate li biti zabrinuti?

Delta varijanta (B.1.617.2) rodila je nekoliko pod-loza zvanih 'Delta Plus' varijante koje nose većinu svojih karakterističnih mutacija, ali se razlikuju na druge načine. Jedna od ovih pod-loza, AY.12, ima sve karakteristične Delta mutacije osim jedne.

Ljudi stoje u redu za primanje doze cjepiva Covid-19 u privremenom centru za cijepljenje postavljenom unutar škole u Mumbaiju, utorak, 17. kolovoza 2021. (PTI Photo/Kunal Patil)

Budući da svijet nervozno prati sve nove varijante Covid-19 i njegove pod-loze, svaki uzorak virusa je tehnički nova 'varijanta', jer se njegov slijed ne podudara s sekvencom bilo kojeg drugog virusa.

Sada su znanstvenici proširili obitelj Delta s četiri na 13 varijanti. Neki slučajevi od Delta varijanta , najraširenija varijanta zabrinutosti u Indiji, reklasificiraju se u drugu pod-lozu - AY.12 - koja je povezana s velikim brojem slučajeva u Izraelu, konzorcij za indijski SARS-CoV-2 Genome (INSACOG), koji prati varijante u nastajanju, stoji u izvješću.

Međutim, budući da je definicija AY.12 nedosljedna, konačni brojevi će potrajati neko vrijeme, stoji u izjavi konzorcija.

Dakle, što je ovo AY.12 mutacija?

U osnovi, virusna evolucija funkcionira kao i svaka druga vrsta. Kako se virus širi tijelom, stvara kopije samog sebe, koje često imaju male pogreške i promjene.

Kao takva, varijanta Delta (B.1.617.2) rodila je nekoliko pod-loza nazvanih varijante „Delta Plus” koje nose većinu svojih karakterističnih mutacija, ali se razlikuju na druge načine. Jedna od ovih pod-loza, AY.12, ima sve karakteristične Delta mutacije osim jedne.

Povećanje broja slučajeva u Izraelu zabrinjava jer je to zemlja u kojoj je gotovo 60% odraslih osoba potpuno cijepljeno i izvještava da je učinkovitost cjepiva Pfizer u toj zemlji znatno manja od onoga što se pokazalo tijekom kliničkih ispitivanja. Reklasifikacija je prvenstveno za pomoć mikroepidemiologiji i ne temelji se na stjecanju značajnih mutacija. Stoga, trenutno nije poznato je li AY.12 klinički drugačiji od Delte, navedeno je u izvješću INSACOG-a. U proteinu šiljaka (S) nisu zabilježene nove mutacije koje izazivaju zabrinutost. Međutim, njegov brzi rast u Izraelu znači da ga treba dalje ispitati.

Postoji li razlika između AY.12 i ostalih sojeva?

Prema INSACOG-u, još nije poznato je li AY.12 klinički drugačiji od Delte ili B.1.617.2.

Međutim, AY.12 je izgubio neke od mutacija viđenih u Delta lozi, kao što je G142D u spike proteinu. U proteinu šiljaka ove varijante nisu zabilježene nove mutacije koje izazivaju zabrinutost.

AY.12 je trenutno najdominantniji soj u Izraelu - 51 posto proučavanih uzoraka pokazalo je prevalenciju ove varijante. Na temelju broja sekvenci koje su indijske istraživačke grupe dosad prenijele na GISAID, prevalencija ove varijante tijekom prošlog tjedna porasla je na preko 20 posto.

Dok je od država tražio da budu oprezne i paze na ovu varijantu, INSACOG je rekao: AY.12, ponovno dodijeljena pod-loza Delta se vidi u mnogim državama, ali brojevi trebaju pomnije ispitati. Funkcionalni utjecaj promjena između Delta i AY.12 nije poznat, ali čini se da su te dvije vrlo slične na molekularnoj razini.

Do sada je, prema INSACOG-u, sekvencionirano oko 70.000 uzoraka koronavirusa zbog njihove genomske strukture, od kojih je 50.000 dodijeljeno različitim linijama. Oko 60% njih sastoji se od međunarodnih varijanti zabrinutosti ili interesa (VoC ili VoI) koje se globalno prate i povezuju s epidemijama, kao i slučajevima proboja cjepiva i ponovnih infekcija. Unutar ovih VoC, varijanta Delta obuhvaća 70% uzoraka. Slučajevi Delta plus, u koje je uključen AY.12, samo su 67, iako se očekuje da će porasti nakon reklasifikacije.

Praćenje evolucije

Outbreak.org, koji prati nove varijante i njihovu prevalenciju, navodi da je prvi slučaj loze AY.12 zabilježen 7. rujna 2020. Od tada su otkrivene 44 083 sekvence u lozi AY.12 diljem svijeta do kolovoza 26.

Međutim, varijanta je došla do izražaja nakon što je postala dominantna vrsta u Izraelu. Četvrti val infekcija ubrzano se približava razinama najgorih izraelskih dana pandemije prošle zime. Dnevna stopa potvrđenih novih slučajeva virusa više se nego udvostručila u posljednja dva tjedna, što je Izrael učinilo sve većom vrućom točkom na međunarodnim ljestvicama. Ograničenja okupljanja i komercijalnih i zabavnih prostora ponovno su uvedena ovog tjedna, a vlada razmišlja o novom zatvaranju.

Međutim, većina stručnjaka zabrinuta je da visoka stopa zaraza u Izraelu među ranim primateljima cjepiva može ukazivati ​​na slabljenje zaštite cjepiva s vremenom, nalaz koji je pridonio odluci SAD-a da počnu nuditi dopunske injekcije Amerikancima od sljedećeg mjesec. Cjepivo bi moglo biti manje učinkovito u sprječavanju infekcije vrlo zaraznom varijantom A.12 Delta, sada primarnom verzijom virusa u Izraelu.

Podaci koje je objavilo izraelsko Ministarstvo zdravstva krajem srpnja sugeriraju da je Pfizer injekcija bila samo 39% učinkovita u sprječavanju infekcije u zemlji krajem lipnja i početkom srpnja, u usporedbi s 95% od siječnja do početka travnja. U oba razdoblja, međutim, injekcija je bila više od 90% učinkovita u prevenciji teške bolesti. Kao takav, Izrael sada svoje nade polaže u pojačivače.

Prema Outbreak.org, prvi uzorak AY.12 u Indiji datira od 7. rujna 2020.

INSACOG je do sada sekvencirao 67.699 uzoraka virusa iz Indije, od kojih je 50.869 detaljno analizirano. Državne vlade podijelile su dodatnih 11.016 sekvenci uzoraka - čime je ukupan broj sekvenciranih uzoraka iznosio 78.865.

Međutim, zabrinjavajući je trend da je u Indiji dosad zaraženo više od 3,2 milijuna ljudi, do danas je sekvencirano samo oko 0,002% uzoraka.

Što je važno općem narodu?

Nisu sve varijante koje je priznala Svjetska zdravstvena organizacija jednako loše. Kada organizacija novoj obitelji da ime, ona također dodaje oznaku koja nam govori koliko bismo trebali biti zabrinuti.

Najniža razina je varijanta interesa, što znači da je vrijedno paziti. U sredini je varijanta zabrinutosti, poput Delte, koja je evoluirala u opasniju. Često se varijante interesa daju tom oznakom jer dijele mutaciju s varijantama koje izazivaju zabrinutost - pod nadzorom su. CDC ima dodatnu, težu kategoriju, varijantu visoke posljedice, koja nikada nije dobila obitelj Covida. Rezervirano je za potencijalne buduće sojeve koji bi mogli uzrokovati ozbiljne bolesti kod cijepljenih ljudi, koji se ne pojavljuju na uobičajeno korištenim dijagnostičkim testovima ili se možda odupiru višestrukim tretmanima za simptome covida.

Mutacije se događaju nasumično u genomima virusa kod svih milijuna ljudi koji su zaraženi. Neke od tih mutacija izumiru, a neke se šire na druge ljude. Kao takvi, znanstvenici pomno prate uzorke u Delti, pogotovo jer se širi tako brzo.

bilten| Kliknite da biste dobili najbolja objašnjenja dana u svoju pristiglu poštu

Podijelite Sa Svojim Prijateljima: