Objašnjeno: Zašto se Delta varijanta Covid-19 širi brže od drugih sojeva

Više ljudi zaraženih Delta varijantom Covida-19 vjerojatno će prenijeti infekciju na druge prije nego što posumnjaju da bi mogli biti bolesni.

Prodavač koji nosi masku za lice kao mjeru opreza protiv koronavirusa izlaže igračke za prodaju na plaži Fort Kochi u Kochiju, Kerala, ponedjeljak, 23. kolovoza 2021. (AP Photo: R S Iyer)

Dok se znanstvenici utrkuju s vremenom kako bi pronašli biološku osnovu za prijenos Delta varijanta Covid-19, nekoliko novih studija otkrilo je da ključne mutacije smanjena učinkovitost cjepiva , te visoka zaraznost tijekom predsimptomatske faze u bolesnika među glavnim su razlozima koji pokreću brzo širenje.

Nedavna epidemiološka istraživanja sugeriraju da je varijanta Delta (B.1.617.2) najmanje 40 posto prenosiva od Alpha varijante koja je prvi put identificirana u Ujedinjenom Kraljevstvu krajem 2020. Štoviše, s više studija pokazujući smanjenu učinkovitost cjepiva protiv Delta varijante, potpuno cijepljene osobe također ostaju ranjive na probojne infekcije .

Šef WHO-a Tedros Adhanom Ghebreyesus, na brifingu za novinare, ranije je rekao da je Delta najprenosivija varijanta identificirana do sada, i da brzo postaje dominantni soj Covid-19 u mnogim zemljama. Prema internoj prezentaciji koja je kružila unutar američkih centara za kontrolu i prevenciju bolesti (CDC), varijanta Delta je prenosiviji nego virusi koji uzrokuju MERS, SARS, ebolu, prehladu, sezonsku gripu i velike boginje, a zarazan je barem kao vodene kozice.

Izvor: JHU CSSE i covariants.org

Zašto je varijanta Delta zaraznija?

Nedavna istraživanja sugeriraju da ključna mutacija aminokiselina može biti iza žestoke infektivnosti Delta varijante.

Tim istraživača na čelu s virusologom Medicinske podružnice Sveučilišta Texas Pei-Yong Shi usmjerio se na ključnu mutaciju koja mijenja jednu aminokiselinu u proteinu SARS-CoV-2. Promjena se zove P681R i pretvara ostatak prolina u arginin, prema izvješću o studiji objavljenom u časopisu Nature. Promjena se događa na mjestu cijepanja furina proteina šiljaka.

Kako bi prodro u stanice, proteini domaćini moraju dvaput presjeći protein SARS-CoV-2. Mjesto cijepanja furina u Covid-19 značajno je jer to znači da enzimi domaćina, uključujući furin, mogu napraviti prvi rez. Nakon toga iz zaražene stanice izlaze novoformirane virusne čestice koje mogu učinkovitije inficirati stanice domaćina.

Alfa varijanta također nosi mutaciju na istom mjestu, iako uključuje promjenu u drugoj aminokiselini. Studija navodi da je u slučaju Delte, mutacija koja mijenja cijepanje furina imala dubok učinak.

U prethodnom otisku studije koja je nedavno stavljena na raspolaganje, istraživači su izjavili da se protein šiljaka mnogo učinkovitije reže u česticama Delta varijante nego u Alfa, pri čemu je mutacija P681R uvelike odgovorna za učinkovito odsijecanje šiljka.

Studija navodi da mutacija P681R drži ključ visoke infektivnosti i brzog prijenosa Delta varijante. Istraživači su otkrili da se u inficiranim kultiviranim epitelnim stanicama ljudskih dišnih putova, Delta varijante šire brže od Alpha. Ali kada su istraživači uklonili mutaciju P681R, razlika u brzinama prijenosa je izgubljena.

Studija je odraz nalaza istraživanja koje je proveo tim pod vodstvom Keija Satoa, virologa sa Sveučilišta u Tokiju, koji je otkrio da se šiljasti proteini koji nose P681R mogu stopiti s plazma membranama nezaraženih stanica gotovo tri puta brže nego da se mutacija nedostaje.

Izvor: CoVariants.org i GISAID putem Our World in Data

Jesu li druge ključne mutacije također odgovorne za Deltin brzi prijenos?

Znanstvenici su rekli da varijanta Delta ima nekoliko ključnih mutacija i da promjena P681R, iako značajna, vjerojatno neće biti jedini razlog koji potiče njegov brzi prijenos.

Istraživači u Ugandi rekli su da je promjena P681R prisutna u varijanti koja se raširila u zemlji početkom 2021., ali se nije pokazala toliko zaraznom kao Delta. The Kappa varijanta , Deltin brat koji je identificiran u Indiji, također je imao istu mutaciju, ali istraživači su otkrili da se njegov šiljasti protein rjeđe cijepa i manje učinkovito spaja sa staničnim membranama.

Prethodne studije su otkrile da druge ključne mutacije u varijanti Delta kao što su L452R i D6146 omogućuju virusu da se čvršće veže na stanice receptora i lakše izbjegne imunitet.

Zapravo, Delta varijanta ima višestruke mutacije u podjedinici S1 šiljastog proteina, uključujući tri u domeni vezanja receptora, što poboljšava njezinu sposobnost da se veže na ACE2 receptore i izbjegne imunološki sustav tijela.

Mislim da virus uspijeva u volumenu i brzini. Postao je mnogo učinkovitiji virus. Prolazi kroz ljude i prolazi kroz stanice puno brže, rekao je za Nature Gary Whittaker, virolog sa Sveučilišta Cornell.

Whittaker je nadalje rekao da je studija naglasila važnost mutacija na mjestu cijepanja furina koronavirusa. Također je dodao da P681R neće biti posljednja mutacija mjesta cijepanja furina koja izaziva zabrinutost.

Izvor: CoVariants.org i GISAID putem Our World in Data

Zašto je tako teško zaustaviti širenje Delta varijante?

Jedan od drugih razloga za brzo širenje varijante Delta, kako je utvrđeno tijekom studije u Guangzhouu u Kini, je iznimno visoka razina infektivnosti pacijenata čak i u predsimptomatskoj fazi. To znači da su ljudi u opasnosti od širenja virusa čak i prije nego što posumnjaju da bi mogli biti zaraženi.

Nedavno istraživanje Benjamina Cowlinga, epidemiologa sa Sveučilišta u Hong Kongu i njegovih kolega, pokazalo je da su ljudi počeli imati simptome 5,8 dana nakon infekcije Delta - 1,8 dana nakon što su prvi put bili pozitivni na virusnu RNA. To, dakle, ostavlja opasan prozor za prijenos virusa.

Drugim riječima, budući da se simptomi javljaju kasnije, više ljudi zaraženih varijantom Delta vjerojatno će prenijeti infekciju na druge čak i prije nego što posumnjaju da bi mogli biti bolesni.

Studija je pokazala da se 74% infekcija Deltom dogodilo tijekom predsimptomatske faze. Istraživači su također otkrili da je R-naught, odnosno osnovni reprodukcijski broj, koji u prosjeku predstavlja broj ljudi za koje se može očekivati ​​da će jedna zaražena osoba prenijeti tu bolest, za Deltu 6,4. Da stvari stavimo u perspektivu, R-naught soja Wuhan, prema nekoliko studija provedenih ranije, bio je između 2 i 4.

Je li smanjena učinkovitost cjepiva protiv Delte zabrinjavajuća?

Nekoliko studija je otkrilo da je učinkovitost cjepiva smanjena protiv varijante Delta, što zauzvrat ostavlja potpuno cijepljene pojedince ranjivim na prodorne infekcije.

Ranija studija javnog zdravstva Engleske otkrila je da se učinkovitost cjepiva Oxford-AstraZeneca svodi na 64% u odnosu na varijantu Delta . Ranije je studija objavljena u časopisu The Lancet također otkrila da će oni koji su potpuno cijepljeni cjepivom Pfizer vjerojatno imati više od pet puta niže razine neutralizirajućih antitijela protiv Delta varijante u usporedbi s izvornim sojem.

Nedavno su podaci izraelskog ministarstva zdravlja pokazali da su dvije fotografije Pfizera nude 64% zaštite protiv Covida, u vrijeme kada je više od 90 posto prijavljenih slučajeva u zemlji uzrokovano varijantom Delta.

Još jedno područje zabrinutosti je učinkovitost cjepiva koja s vremenom slabi. Istraživači sa Sveučilišta Oxford u Ujedinjenom Kraljevstvu i Ureda za nacionalnu statistiku zemlje u nedavnoj su studiji otkrili da je učinkovitost cjepiva Pfizer pala na 90 posto mjesečno nakon uzimanja druge doze, na 85 posto nakon dva mjeseca i 78 posto nakon tri. Za AstraZenecu, ponuđena ekvivalentna zaštita iznosila je 67, 65 i 61 posto.

Studija je također otkrila da čak i kod potpuno cijepljenih ljudi, infekcije uzrokovane varijantom Delta izazivaju vrhunac virusnog opterećenja koji je bio sličan onom u necijepljenih osoba. Studije provedene u SAD-u i Singapuru dale su slične rezultate.

To znači da je najveća briga da čak i potpuno cijepljeni ljudi mogu širiti Delta varijantu, što otežava prekid lanca prijenosa.

Izvješće koje je CDC objavio ovog mjeseca navodi da je nakon velikih okupljanja u gradu Provincetown u Massachusettsu, u državi prijavljeno 469 slučajeva Covid-19, od čega je gotovo tri četvrtine među cijepljenim osobama.

Analizom je utvrđeno da su, kao i necijepljeni, povišeni bili i oni koji su primili ubode Ct vrijednosti , što ukazuje na visoko virusno opterećenje. Nakon sekvenciranja genoma 133 uzorka, utvrđeno je da je 90% slučajeva uzrokovano varijantom Delta. Nakon nalaza, CDC je 27. srpnja još jednom ažurirao svoje smjernice, te preporučene, pa čak i cijepljene osobe trebale bi nositi maske kada se nalaze u područjima koja imaju značajan i visok prijenos Covid-19.

Podijelite Sa Svojim Prijateljima: