Objašnjeno: Koliko se brzo širi novi soj koronavirusa? Hoće li to utjecati na cijepljenje?

Novi soj koronavirusa u UK: Indija i nekoliko drugih zemalja obustavile su letove za i iz UK. Koje su mutacije dovele do varijante koronavirusa koja je izazvala zabrinutost? Koliko se brzo proširio? I hoće li to utjecati na cijepljenje?

Letovi iz Britanije otkazani su u zračnoj luci Cointrin, u Ženevi, Švicarska, 21. prosinca 2020. (Foto Reuters: Denis Balibouse)

U ponedjeljak Indija obustavio sve letove iz i u UK do 31. prosinca, usred zabrinutosti oko a nova varijanta SARS-CoV-2 koji se tamo širi i brzo raste. Nekoliko drugih zemalja također je obustavilo letove u Ujedinjenom Kraljevstvu i uvelo ograničenja putovanja.

Koje zabrinutosti dovode do ograničenja putovanja?

Prošlog tjedna otkriveno je da je nova varijanta SARS-CoV-2 razlog brzog porasta slučajeva Covid-19 u južnoj i istočnoj Engleskoj. Naziva se VUI (Variant Under Investigation) 202012/01, ili loza B.1.1.7.

Tijekom posljednjih nekoliko dana, zahvaljujući našim genomskim sposobnostima svjetske klase, identificirali smo novu varijantu koronavirusa, koja bi mogla biti povezana s bržim širenjem na jugu Engleske, rekao je britanski ministar zdravstva Matt Hancock za House of Commons. 14. prosinca. Britanske vlasti već su obavijestile Svjetsku zdravstvenu organizaciju o ovoj varijanti.

Public Health England (PHE) objavila je da je do 13. prosinca identificirano 1.108 slučajeva s ovom varijantom, pretežno u južnoj i istočnoj Engleskoj. PHE radi s partnerima na istrazi i planira podijeliti svoje nalaze u sljedeća 2 tjedna, stoji u priopćenju.

Kakva je varijanta?

Varijanta je identificirana u genomskom nadzoru od strane COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konzorcija koji analizira podatke sekvenciranja genoma iz Ujedinjenog Kraljevstva. COG-UK najveći je doprinos globalnoj bazi podataka o Covid-19 GISAID.

Varijanta je rezultat višestrukih mutacija šiljastog proteina novog koronavirusa SARS-CoV-2, kao i mutacija u drugim genomskim regijama RNA virusa. Preliminarna analiza ukazuje na to da je prijenosniji od prethodno cirkulirajućih varijanti. COG-UK je identificirao jednu od ovih mutacija kao N501Y, u području šiljastog proteina koji se veže na ključni protein u ljudskoj stanici, ACE2 receptor. To je bio pokazatelj da promjene mogu, teoretski, dovesti do toga da virus postane zarazniji. U tijeku su napori da se potvrdi pridonosi li bilo koja od ovih mutacija povećanom prijenosu, rekao je konzorcij.

Što do sada znamo o prenosivosti i težini bolesti?

PHE je u nedjelju rekao da podaci iz sekvenciranja cijelog genoma, epidemiologije i modeliranja sugeriraju da se nova varijanta lakše prenosi od drugih sojeva.

Međutim, također je naglašeno da nema dokaza da je veća vjerojatnost da će varijanta uzrokovati tešku bolest ili smrtnost. … Ali nastavljamo s istragama kako bismo to bolje razumjeli, piše. Rečeno je da je smrtnost pokazatelj koji zaostaje i da će to kontinuirano pratiti tijekom sljedećih tjedana.

PHE je rekao da još ne zna mehanizam za ovo povećanje prijenosa. Znamo da mutacije u spike proteinu, dijelu virusa koji ga čini zaraznim, mogu promijeniti način interakcije virusa s ljudskim stanicama, kaže se.

Rečeno je da dokazi pokazuju da su stope infekcije u zemljopisnim područjima u kojima je ovaj soj cirkulirao porasle brže nego što se očekivalo, a dokazi modeliranja su pokazali da ova varijanta ima veću stopu prijenosa od drugih varijanti u trenutnoj cirkulaciji.

Novi soj koronavirusa u Velikoj Britaniji: Policajac usmjerava promet na ulazu u zatvoreni trajektni terminal u Doveru u Engleskoj u ponedjeljak, nakon što je luka Dover zatvorena. (AP fotografija)

Koliko je zabrinjavajuća veća prenosivost?

Dana 18. prosinca, New and Emerging Respirator Virus Threats Advisory Group (NERVTAG), koja savjetuje vladu Ujedinjenog Kraljevstva o prijetnji koju predstavljaju novi respiratorni virusi u nastajanju, rekla je da bi nova varijanta mogla potencijalno povećati broj reprodukcije bolesti do 0,93 . Rečeno je da ima umjereno povjerenje da nova varijanta pokazuje značajno povećanje prijenosa u usporedbi s drugim varijantama.

Stručno tijelo je, međutim, zaključilo da trenutno nema dovoljno podataka da bi se izveo zaključak o temeljnom mehanizmu povećane prenosivosti, dobnoj raspodjeli slučajeva i težini bolesti. Rečeno je da su identificirane 4 smrti u oko 1000 slučajeva, ali je potreban daljnji rad na usporedbi ove stope smrtnosti s usporedivim skupovima podataka.

Položaj mutacija u domeni šiljastog glikoproteina koji veže receptore povećava mogućnost da se ova varijanta antigenski razlikuje od prethodnih varijanti. Četiri vjerojatne reinfekcije identificirane su među 915 ispitanika s ovom varijantom, ali je potreban daljnji rad na usporedbi ove stope reinfekcije s usporedivim skupovima podataka, navodi se.

U nedjelju, sažetak procjene prijetnje koji je objavio Europski centar za prevenciju i kontrolu bolesti kaže da filogenetska analiza otkriva da se klaster razlikuje za 29 nukleotidnih supstitucija od izvornog soja Wuhan. Tri sekvence iz Danske i jedna iz Australije, iz uzoraka prikupljenih u studenom 2020., grupiraju se s varijantom u Ujedinjenom Kraljevstvu, što najvjerojatnije ukazuje da je došlo do međunarodnog širenja, iako je opseg i dalje nepoznat, navodi se.

Novi soj koronavirusa u Velikoj Britaniji: Luka Dover zatvara se jer zemlje EU-a uvode zabranu putovanja iz Ujedinjenog Kraljevstva. (Fotografija Reutersa)

Ali nije li virus prije mutirao?

Kad god se virus replicira i cirkulira u ljudskoj populaciji, mutacije se javljaju prirodno, brzinom od oko jedne do dvije mutacije mjesečno u globalnoj filogeniji.

Zapravo, za SARS-CoV-2, COG-UK kaže da trenutno postoji oko 4000 mutacija u spike proteinu. Varijanta D614G je ranije bila dominantna vrsta jer se vrlo lako širila. Još jedan soj koji potječe od španjolskih poljoprivrednika, 20A. EU1, ljeti se brzo širi Europom.

Teško je predvidjeti je li neka mutacija važna kada se prvi put pojavi, s obzirom na kontinuirano nastajanje novih mutacija. Razumijevanje njihovog značaja moglo bi biti moguće na temelju eksperimentalnog rada koji pokazuje vezu između mutacije i suptilne promjene u biologiji virusa. Međutim, bilo bi potrebno dosta vremena i truda da se testira učinak mnogih tisuća kombinacija mutacija, rekao je COG-UK.

Hoće li to utjecati na razvoj cjepiva i odgovor?

U nedjelju su britanske vlasti rekle da se daljnji laboratorijski rad poduzima kao prioritet kako bi se ovo razumjelo. Trenutačno nema dokaza koji bi sugerirali da cjepivo Pfizer ne bi zaštitilo ljude od novog soja, rekao je PHE.

Podijelite Sa Svojim Prijateljima: